Dulce Yamileth Medina Valenzuela, Francisco Josué Carrillo-Ballesteros, Diana Emilia Martínez-Fernández, Ángel Medina Reyes, Sara Landeras-Bueno, Cesar Arturo Nava-Valdivia, José Ángel Regla-Nava
La COVID-19 es causada por el virus del síndrome respiratorio agudo severo tipo-2 (SARS-CoV-2). La variabilidad genética del virus afecta la interacción virus–huesped, la transmisibilidad, patogenicidad y evasión inmunológica es muestra de ello. La región RBD localizada en la proteína S es una de las zonas con mayor acumulación de mutaciones. La mutación T478K es una de las más relevantes que se ha asociado en favorecer la transmisibilidad y evasión del sistema inmune.
Identificar y caracterizar la mutación T478K en aislados de SARS-CoV-2 en población de Jalisco.
Estudio transversal analítico. n=34 muestras, 23 hombres (M) y 9 mujeres (F); distribuidas en 4 olas pandémicas, enero 2021 a agosto 2022. La distribución por olas fue: 10, 10, 5 y 7 respectivamente. Se amplificó la región RBD mediante una reacción en cadena de la polimerasa (PCR), y se prosiguió a su secuenciación por Sanger. La mutación T478K fue modelada en diversos contextos de antígeno- (RBD) vs anticuerpo-(ACE2 receptor celular) utilizando PDB, Quimera X, Prodigy y PDBePISA. IBM SPSS Statistic V22.0 como sofware estadístico.
La prevalencia de la mutación T478K fue 40.62% general, 39.13% en M y 44.44% en F. Su distribución por olas fue 10%, 100%, 20% y 14.28% respectivamente. La edad promedio de los pacientes con la mutación fue de 33.11% en M y 66.5% en F. La distancia de la mutación T478K vs ACE2 fue de 12.2Ȧ vs 11.3Ȧ correspondiente a la distancia silvestre. Además T478K dio origen a un cambio funcional del aminoácido polar neutro a polar básico.
La identificación de T478K va acorde con los tiempos de circulación de las variantes alpha, beta, gamma, delta, epsilon y omicron. Los cambios conformacionales encontrados antígeno-anticuerpo refuerzan su posible implicación en las funciones previamente descritas. Estos resultados contribuyen a comprender la historia natural de la COVID-19.
Introducción del autor